2003 bộ thương mại và công nghệ Nhật đã ủy nhiệm cho nghiên cứu về máy bay khu vực 30 chỗ ngồi. Cho tới khi chương trình chính thức bắt đầu vào tháng 3 năm 2008 thì họ dự định chế tạo máy bay từ 70 tới 90 chỗ ngồi sau khi được đặt hàng bởi All Nippon Airways. chiếc máy bay đầu tiên bắt đầu được chế tạo vào ngày 30 tháng 9 năm 2010. Tuy nhiên mãi tới tháng 11 năm 2015, chiếc máy bay đầu tiên mới được cất cánh, dự định sẽ giao hàng vào quý nhì 2017.[12] Đến nay, công ty đã nhận được đơn đặt hàng cho 223 chiếc.[11]

Nỗ lực của Nhật Bản để thành lập công ty sản xuất máy bay thương mại nội địa đầu tiên thất bại, khi công ty chế tạo nó là Mitsubishi chỉ bán được 182 chiếc. Tuy nhiên, Mitsubishi lại hưởng lợi từ chương trình này, thắt chặt quan hệ với hãng Boeing, và trở thành nhà cung cấp chính cũng như đối tác của công ty này. Tập đoàn Mitsubishi và tập đoàn ôtô Toyota mỗi bên sở hữu 10% công ty MRJ.[11]